היגרומה הציסטית יש תרופה, אבל זה אפשרי כי הגידול עשוי לחזור אחרי כמה זמן זה עדיין לא ניתן להסביר את הסיבה.
הטיפול בהיגרומה ציסטית מורכב מיישום של זריקה עם חומר סקלרוטי שיכול להרוס את הנוזל הממלא את הגידול. נוזל זה מגיע מהמחזור הלימפה ולמרות שלא ידוע מדוע הוא יוצר את הציסטה, אנשים מסוימים יכולים לפתח אותו בחיים הבוגרים.
התרופה הטובה ביותר לחסל את היגרומה ציסטית היא Ok432, אשר אין תופעות לוואי והוא לא רעיל והוא יכול לחסל את הגידול על היישום הראשון רוב הזמן. בהתאם למיקום של הציסטה, הרופא יכול לבצע אולטרסאונד כדי לדמיין טוב יותר את האזור כדי לטפל על מנת למנוע את היישום של התרופה ברקמות אחרות גרימת נזקים גדולים יותר.
יישום זה נעשה במרפאה או בבית החולים הפרט לא צריך להתאשפז, אם כי יש צורך לנוח ולהימנע מאמצים בתוך שלושה ימים לאחר הטיפול. אם היגרומה גדולה מאוד ומונעת את התנועה החופשית של המפרק בסמוך למיקומה, כגון הברך, המרפק או הצוואר, ייתכן שיהיה צורך לבצע כמה טיפולים פיזיותרפיים כדי להפחית את הכאב ולהגדיל את טווח התנועה.
כשמדובר היגרומה ציסטית העובר הרופא עשוי להעריך את הצורך ניתוח כדי להסיר את הציסטה, אבל זה יהיה תלוי במיקום שלה. ציסטות הממוקמות באזור subdural של המוח או קרוב מאוד האיברים החיוניים יש לראות כמה זמן לפני תחילת הטיפול ואת הסיכון / תועלת הנסיגה יש להעריך.